В декабре 1999 году двое парней, Алексей и Денис, из развалившегося проекта TOMB организовали новый, под названием FLEGETHON, взятым из греческой мифологии: третья река Ада после Ахерон и Стикс. Однако, активную деятельность группа начала в сентябре 2000 года. Назвав себя De'Meon и Oden соответственно, в октябре коллектив приступает к написанию материала к будущему демо в стиле, названном ими nonharmonical derelaxation suicidal ambient с элементами noise. К концу 2000 года работа над первым релизом благополучно завершается, после чего уже в новом тысячелетии FLEGETHON выпускает кассеты «Когда жизнь подходит к концу…» и распространяет малым тиражом в Москве, Питере, Тампере (Финляндия) и других городах России.


Зимой 2001 года было написано ещё несколько композиций для дебютного альбома «The last stage of depression» и немного изменены "Долина утопших душ" и "Войдя во Врата Нергала", а также ремастированы все остальные композиции с демо. Работа была полностью завершена 3 марта 2001 года. Вокальные партии для последней темы "Suicidal opera of the patients" записывались при 20-градусном морозе на льду Финского залива в двух километрах от берега.

25 ноября 2001 года полностью завершена запись второго альбома «Outside of the consciousness». В музыкальном плане его трудно охарактеризовать каким-либо одним направлением, но в грубом приближении – dark ambient black doom. На альбом вошли 10 композиций, одна из которых – кавер-версия песни “Hey you” группы PINK FLOYD.

23 мая 2002 года завершена работа над третьим альбомом под названием «Dekadanse», который состоит из двух композиций протяжённостью по 22 минуты. В процессе его написания группа записывает ряд композиций, которые составили основу сборника нереализованных вещей «There is no echo of reality», увидевшего свет в начале 2003 года.

К сожалению музыкантам пришлось разъехаться и по ряду обстоятельств De'Meon временно покинул группу и FLEGETHON превратился в one-man-band в лице Oden'а и передислоцировался в город Байконур.


30 сентября 2003 года FLEGETHON записывает демо «The Absolute Laws of Darkness», которое включает в себя 4 новых композиции в стиле raw depressive black, одна из которых кавер-версия песни "Aether" известной финской funeral doom банды SKEPTICISM . Демо распространяется лимитированным тиражом в кассетном варианте.

20 августа 2004 года новый российский андеграундный лэйбл Satanarsa Records выпускает мультимедийный видеоклип к композиции "Полночь" с альбома «Outside of the consciousness», который составляет мультимедийную секцию к альбому «There is no echo of reality».

23 августа 2004 года все релизы FLEGETHON, кроме «Когда жизнь подходит к концу…», выпущены на лэйбле Satanarsa Records. Демо «The Absolute Laws of Darkness» переиздано в CD-варианте.

1 декабря 2005 года Oden завершил запись нового альбома «Behind a side of times», выполненного в стиле ambient funeral doom. Лирика основана на произведении Г. Ф. Лавкрафта. Диск вышел лимитированным тиражом 100 копий на лейбле Satanarsa Records.

23 июня 2006 года Oden записал новый незапланированный релиз «Cry of the ice wolves II» в виде одного трека продолжительностью больше 40 минут, который продолжает идею, начатую на альбоме «The last stage of depression». Здесь слушателю предоставляется minimalistic apocalyptic funeral doom/black в исполнении группы FLEGETHON. Диск выпущен лимитированным тиражом 50 копий, пронумерованных вручную, первые 10 из которых с эксклюзивным оформлением и автографом автора.

13 апреля 2007 года лейбл Satanarsa Records допечатывает дополнительный тираж альбома «Cry of the ice wolves II» в количестве 50 копий.

10 мая 2007 года подписан договор с лейблом Marche Funebre Prod. на издание альбома "Behind a side of times".

5 августа 2007 года завершена запись 8-го полноформатного альбома «The Art of Regeneration», который продолжает линейку фюнеральных релизов группы. На альбоме представлено 6 композиций - кавер-версии известных произведений таких композиторов и исполнителей, как Robert Miles, Ennio Morricone, James Last, Frederick Chopen, ERA, ENIGMA, исполненные в стиле gothic funeral doom.


10 февраля 2008 года альбом «Behind a side of times» издан на российском "похоронном" лейбле Marche Funebre Prod. в slip-case-формате.

26 мая 2008 года на андеграундном лэйбле экспериментальной музыки B-Rush издан сплит UNDER/FLEGETHON «Lost paradise», который являестся частью серии металлических релизов «666 corpses». На сплит вошла одноимённая композиция UNDER с альбома 2001 года и композиция FLEGETHON "Lost paradise pt.II", ранее нигде не издававшаяся.

11 августа 2008 года издан сплит FLEGETHON/EXANIMUS «From the dead ground / Ослепни, оглохни, сдохни» - совместный релиз двух лейблов: Satanarsa Records и The Kether Crown Prod., на который вошли композиции с альбомов 2002 и 2003 года группы FLEGETHON, представляющие всё бл